Los usuarios que estén familiarizados con GMT y GDAL se encontrarán como en casa con MB-System. De hecho, MB-System hace uso intensivo de GMT para el renderizado de mapas. MB-System es una suite modular y dirigida mediante líneas de comando, de unos 75 programas que trabajan conjuntamente para procesar datos masivos de sonar de barrido lateral y batimétricos multihaz de rastreo (incluso terabytes) usando automaticaciones mediante guiones (scripts). Los ficheros se pueden dejar mezclados e intactos en el disco duro en docenas de formatos y solo los que sean necesarios serán seleccionados automáticamente, permitiendo el procesamiento eficiente y la combinación sin errores de juegos de datos obtenidos en diferentes tiempos, por diferentes embarcaciones y en diferentes formatos. Se incluye también software para la generación de salidas cartográficas y la limpieza avanzada de datos 3D.
Puede también consultar la entrada en wiki de GRASS sobre MB-System